进入上世纪90年代后，我国通过技术引进，进口了俄罗斯的“马斯基特”3M80/3M82系列反舰导弹和X-31A型反辐射导弹，前者是现代级驱逐舰的专用装备，后者及其仿制型号鹰击-91广泛装备苏-30MKK/MKK2、歼轰-7A和歼-8F等攻击机上。为了满足海空通用的要求，我国又在吸收了3M80/3M82和鹰击-91导弹的技术基础上，完成了新一代鹰击-12超音速反舰导弹的研制，作为歼轰-7B、歼-16和轰-6K等攻击机的反舰武器。总体来说中国超音速反舰导弹的发展主线是以冲压发动机技术为核心，逐步走小型化，通用化的技术路线，这和世界超音速反舰导弹的发展主流相一致。冲压发动机技术路线的优点是全程速度都很快，压缩对方的反应时间和增加拦截干扰难度，缺点在于早期冲压反舰导弹实际上没有航路规划能力，后期有一定的航路规划能力，但是由于速度很大，转弯机动能力受限制，所以弹道仍然相对固定且技术突破比较困难，对工业基础要求较高。
除了发展基于冲压发动机基础上的超音速反舰导弹，我国还在陆续发展了“亚超结合”反舰导弹，也就是对亚音速反舰导弹进行气动修型，仍然以亚音速接近敌舰，然后通过俯冲等手段使得其末段速度超过音速的反舰导弹。其第一种型号是上游2号超音速反舰导弹，上世纪60年代末开始发展，先是发展液体发动机，后来又换装固体发动机，在上世纪80年代末定型，并且于上世纪90年代初装备了053H1G护卫舰。