驻日美军经费图表。
2017年特朗普政府上台后，美方要求增加经费的压力再次加强。据日本广播协会(NHK)21日报道，美国前国家安全顾问博尔顿披露，特朗普曾要求日本每年支付80亿美元的驻日费用，否则就威胁撤走美军。
此外，这些年驻日美军人数一直呈增加趋势。2007年为3.2万人，据美国国防部最新透露，截至2021年9月，驻日美军陆、海、空军和海军陆战队合计达到5.6万人。因此驻日美军的费用成本也一直在上升。虽然不像特朗普时期提出的额度那样巨大，但拜登政府给日本带来的经费负担还是很重。
共同社22日报道称，除了协议外，日本还承担日美特别行动委员会（SACO）相关经费和美军整编相关经费。SACO相关经费与冲绳县美军设施整理及缩小计划有关，而美军整编经费则包含冲绳县普天间机场的搬迁费用等。从2006年度的84亿日元（约合4.7亿元人民币）逐渐增加，2021年度已达2044亿日元（约合114亿元人民币），增至20倍以上。
上述两项负担与包括体贴预算在内的驻留相关经费相加，2021年度达到约6200亿日元。再加上给基地周边地方政府的补贴，还将进一步增加。
此外，虽然根据日美协议，日本负担的驻日美军基地水电燃气费金额减少，但在新增日美联合训练项目上，日方负担费用有所增加。日本外务省相关人士认为，水电燃气费等实际上有上限，但训练物资设备采购费却上不封顶，他们对5年后驻日美军经费分摊协定谈判的前景表示担忧。
朝日新闻22日报道，美军驻扎费用发生质变，外务省官员表示，"真正的负担将从现在开始"。
《朝日新闻》22日援引外务省相关人士的话称，“增幅并不高，表面上看起是个能够被称为‘干得不错’的结果，但拜登政府接下来肯定会要求日本负起‘（与美国）对等的责任’，其实今后会更辛苦。感觉用钱就能打发的特朗普政府的时候可能应对起来更轻松。”《朝日新闻》称，拜登政府将要求日本进一步增加防卫费并强化（在地区的）作用。
一名美国政府官员在接受《朝日新闻》采访时说，“驻日美军不仅加强了日美同盟关系，而且直接有助于该地区的安全与稳定”。
但实际上，驻日美军成了日本民众的“安全隐患”。据观察者网此前报道，长期以来，驻日美军军人犯罪、坠机、高空坠物和噪音扰民等事件频发，美军士兵在冲绳强奸、施暴等事件屡见不鲜。日本民众不堪其扰,要求美军撤出、关闭基地的抗争不断进行。据日本共产党统计，在1952年至2010年，驻日美军犯下了21万起案件，造成1088人死亡。