同济大学等学者取得DNA测序技术的重要突破

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TONGJI

2022年1月17日,我国学者在国际权威刊物《美国化学会志》(Journal of the American Chemical Society)上发表了题为“基于UdgX的在单碱基分辨率水平上的DNA脱氧尿嘧啶的检测技术”的研究论文。借助被称之为UdgX的特殊的酶分子,该研究发明了灵敏性好、特异性强和分辨率高的DNA脱氧尿嘧啶(dU)检测技术,第一次用酶法在单碱基分辨率水平上精准检测DNA中的dU,实现了DNA中dU碱基检测技术的根本性突破。

同济大学等学者取得DNA测序技术的重要突破

众所周知,DNA是生物体的遗传密码。通常认为它们包括腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)四个碱基。后来的研究发现,DNA中还存在另外的碱基dU。这些碱基共同组成了DNA的基本元素。但是,迄今为止人类还难以从单个碱基分辨率水平上检测到dU。这构成了DNA序列检测的盲区和瓶颈之一,严重阻碍了对dU的功能的认知和对DNA遗传密码的理解。

从原核生物到真核生物,从单细胞生物到人类,除外A、T、G和C,它们的DNA中还包含着比例不等的dU。在艾滋病毒的DNA中,每二十个碱基就有一个以上的dU;而在疟原虫的DNA中,dU占碱基的比例大约为十万分之一。dU既能通过C碱基脱氨产生,又能“冒充”T碱基掺入到基因组中。由于缺乏敏感又特异的单碱基分辨率的dU测序技术,迄今为止人类并没有像其它碱基(A、T、G和C)那样实现dU在DNA中的精准定位。也就是说,现在的dU检测技术可以证实若干碱基中存在dU碱基,但是并不能确定dU碱基位于什么样的具体的碱基之间。dU碱基的生物学意义是什么?dU碱基在疾病发生发展中的意义又是什么?要回答这些问题,唯有取得单碱基分辨率水平上的dU碱基的检测和定位的突破,这是前提条件。

dU具有双面性,它有时充当人类健康的朋友,有时又可能是人类健康的敌人。许多报道发现,当机体面对不同抗原时,免疫细胞需要dU作为中间体,产生多种多样的抗体,帮助抵御诸如新冠病毒之类的病原体对人类的侵害。而当肿瘤或者心血管疾病患者体内出现dU时,则可能导致患者的基因组的不稳定,加速这些患者病情的发展。显然,精准检测dU在DNA中的分布情况,将有助于评估人类个体的生理学机能和疾病的预后。