克林顿政府进一步明确了中央情报局的三大使命：一是努力掌握介入武器扩散和恐怖活动的国家的情况，主要是朝鲜和伊朗。
二是严密注视那些政治和经济发展状况可能会使美国感到不安的国家，例如俄罗斯和中国；三是尽一切努力协助美国政府确保美国企业的海外利益。
中情局有着严格的特务选拔程序。
首先，被招募对象不是传统的美国人，而是来自目标国家或威胁国家的移民或移民后代。
通过这种方式有利于这些情报人员打入、渗透至当地社会，更好地获取情报。其次，被招募者往往在某些方面有专长，例如擅长多种当地语言、善于把握人心、可以根据场景需要快速转换身份等。
第三，可以承受高强度训练，善于快速学习。这些要求都是为了更好地完成各种情报搜集任务。
然而，近年来，中情局在舆论场中的负面消息越来越多，不少特务被捕或被击杀。
2014年12月21日，维基解密网站公布了两份中央情报局的机密文件，详细揭露了中情局如何为在国外执行任务的特工“出谋划策”、如何假扮身份进行情报活动。
2017年5月，美国《纽约时报》报道称中国于2010年捣毁了美国中情局一个在华间谍网，令CIA出现了数十年来最重大的安全漏洞。
在这份报道中，数名不愿公开名字的CIA前任或现任官员透露，从2010年底起，美国收到的有关中国政府深层的消息和线报越来越少，CIA在察觉异常后进行了调查才发现，他们中国线人正在不断失踪。
为培养这些“线人”、搭建起这张情报网络，中情局投入了大量的人力、物力和财力，然而这次失踪使得中情局多年来的“努力”化为泡影。有美方官员形容这是美国近年最严重的国家安全妨害事故。
随着时代进步、科技发展，情报工作也越来越科技化。
中情局除了利用情报人员之外，还会采取一些高科技手段，但他们的图谋依然会被拆穿。