2月28日，大陆渔船翻覆2死事件进入第14天，两岸谈判终于有进展了。在2月27日早上紧急返台请示最后谈判底线后，同日下午5点左右，“海巡署”与陆方代表团举行了第九次闭门谈判，双方在会后未对外发言。据知情人士透露，针对陆方要求“公开道歉”部分可能改成“书面致歉”，其他部分28日会继续协商。至于慰抚金（赔偿金）部分，先前已谈到约140万人民币，不过台媒方面报道透露的是大概是170万人民币左右。
27日民进党当面不得已作出让步，跟大陆海警方面的动作紧密相关。27日，大陆方面联合搞了一个大动作，出动了11艘舰船在金厦海域巡查，其中两艘再次进入台当局单方面划设的“禁限水域”。对此，台海巡出动了2艘巡逻艇伴航，并进行所谓广播驱离，不过没人理会他们。
而在27日早上叫嚣要驱逐大陆海警船的台当局“行政院长”陈建仁，直接“跪了”，不敢再提驱离二字，而是秒怂改口称“希望对方尽快撤离”。此前陆方提出要台“海巡署”公布真相、公开道歉、究责，并带回失事渔船及渔民遗体等要求，目前也就只有一个公开道歉变成了“书面致歉”而已，其他的要求估计也只要归还大陆渔船或能谈妥。
而据台媒报道，台海巡有在内部公布了大陆渔船翻覆前后的录音，但是一直没有公布救人部分的录音。民进党当局“海委会”主委管碧玲曾经说漏嘴，称事件的最关键部分其实有大概5分钟左右的录音或录像。目前台当局一直拒绝归还死者遗体，并拒绝大陆方面参与验尸。因此，外界都在怀疑死者遗体方面可能有一些不利于台海巡的证据。
根据蔡正元教授在政论节目中提出的疑问，有几个比较关键的，大陆2名遇难渔民是会游泳的，正常情况下不可能会溺水身亡。因此2名遇难的渔民到底是溺水而死，还是被撞伤后溺水而死，或直接被撞死的，或是被台海巡人员开枪打伤打死的？这些都需要双方法医共同参与验尸才能做出结论。第二大陆2名遇难渔民落水后，台海巡到底有没有参与搜救，在这个过程里面有没有存在故意见死不救等情况。
另外，即使是大陆渔船翻覆2死事件，民进党当局能够糊弄过去。但是台当局私自划定的禁限制水域已经不存在了。大陆海警船已经常态化进入包括厦金水域进行执法，未来一定会扩大到所有的台外岛，最后就是本岛的禁限制水域也会一一被大陆方面突破。而27日，台“海委会主委”管碧玲还在忽悠岛内民众，称这几天大陆公务船进入了金门周围的禁止或限制水域，不过在被台海巡艇警告后不久便自行离开。实际上根本就不是这样，前几天大陆海警和渔船直闯入禁止或限制水域，台海巡艇根本不敢出来。
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