据悉，双方的协商是在马来西亚的斡旋下进行的，协议也是在马来西亚达成，美国和欧盟国家将提供援助和有关有效治理的建议，来帮助协议实施。这些国家希望能够大大削弱该地区伊斯兰叛乱组织的力量。

25日，美国国务卿约翰·克里对“达成一项全面的历史性和平协议的协商成功结束”表示了祝贺。他说，“协议给棉兰老岛现在以及其未来的数代人，带来了和平、安定和经济繁荣的希望。”

自19世纪初以来，棉兰老岛的伊斯兰叛乱组织和菲律宾北部基督徒主导的政府之间的冲突就在持续发酵。1946年菲律宾独立以来，每届政府都曾试图平息暴力，主要通过和平谈判，有时也会诉诸武力。

在最近几十年，冲突据估计已造成12万人丧生，200多万人流离失所。菲律宾南部地区也因此深陷贫困，虽然该国整体出现了一定程度的经济复兴，成为东亚经济增长最快的国家之一。

25日，负责和平谈判事务的总统顾问特雷西塔·金托斯·德勒斯说，“在一个努力以和平方式解决所有问题的世界，我们很庆幸找到了自己的解决方式。”

菲律宾政府和摩伊解从2012年10月，达成结束冲突的框架协议后，就开始商讨和平协议的细节。初期的临时协议涉及权力及资源分配问题。根据这些协议，菲律宾中央政府将保留在国防、外交和货币方面的权力，而新成立的名为邦萨摩洛的自治区将拥有广泛的地方权力。

双方同意，该地区开采的金属矿物的税收收入，将有75%由地方政府保留。除此之外，当地从开采化石燃料取得的税收收入，也将有一半由地方政府保留。