洲际弹道导弹还可以安置在美国海岸水域巡逻的小型柴电潜艇的弹舱内。一旦得到命令，这些弹舱就会弹出水面，发射导弹。但美国海军已拥有核导弹潜艇，且建造新型潜艇也会造价不菲。在浅水海域活动的小型潜艇还容易发生核爆炸。

　　以下两种观点摒弃了潜艇，让导弹依靠自己在水中停留。按照“九头蛇”(Hydra)计划的设想，在非战时或预警时由舰船和潜艇部署，能够在海水中上下浮动、具有防水性能的导弹。一个未击中目标的导弹浮标会对海军部队、渔民和海洋生物等一切事物构成威胁。因此有报告指出，“‘九头蛇’计划的理念带来了前所未有的安全问题。让无人照看的核弹头漂浮在海面上，这一理念会对全球海运航道带来令人无法接受的灾难。”

　　事实上，在美国通用动力公司展开的四分之一项测试中，“杀人鲸”(Orca)计划的理念已说明了一切。按照“杀人鲸”计划的设想，被封装的洲际弹道导弹在海底保持静止状态，在接到命令后，炸开弹舱、浮出水面，发射导弹。但由于发射以轨道为基础，而现有的条约不允许在海底部署核武器，而且通过排查，导弹是可以被探测到的。