目前,新冠病毒已致我国数万人感染,上千人丧生,并蔓延至全球20多个国家。确认中间宿主对阻止病毒的进一步传播至关重要。
此前,研究人员先后提出蝙蝠或是新冠病毒自然宿主,蛇、穿山甲可能是潜在中间宿主。
2月26日,湖北医药学院附属人民医院的刘龙联合广州暨南大学吴建国课题组在《医学病毒学杂志》上发表论文称,
龟类(西部锦龟、绿海龟、中华鳖)也可能是将新冠病毒传播给人类的潜在中间宿主。
最新研究采用冠状病毒刺突蛋白和宿主ACE2受体的组成和差异,预测SARS-CoV-2的潜在中间宿主。
该研究的重点是比较SARS CoV-2与SARS-CoV、蝙蝠SARS样CoV和其他冠状病毒之间的刺突序列。这有助于进行进化分析,并寻找可能的病毒库。此外,对ACE2结构和结合基序比对的分析,有助于提供线索来区分潜在宿主。
SARS-CoV-2编码至少27种蛋白质,包括15种非结构蛋白、4种结构蛋白和8种辅助蛋白。刺突蛋白(S)是一种结构蛋白,位于病毒体的外壳上,负责与宿主受体血管紧张素转换酶2(ACE2)结合。研究刺突蛋白中受体结合区域(RBD)序列的进化关系有助于理解病毒起源趋势。
研究结果表明,蝙蝠SARS样CoV RaTG13与SARS-CoV-2整体基因组具有96.2%的序列同一性。值得注意的是,SARS-CoV是穿山甲标本中分布最广的冠状病毒。
刺突RBD受体相互作用是决定冠状病毒宿主范围的关键因素。研究组对来自SARS-CoV、蝙蝠或穿山甲SARS样CoV和SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD序列进行了比对。
蝙蝠SARS样CoV从第473到第490个残基缺失,位于外部亚结构域,似乎可以确定这些病毒不会自然感染人。
目前并没有直接证据表明,蝙蝠SARS样CoV曾感染人类。
穿山甲SARS样CoV SRR10168377与蝙蝠SARS样CoV RaTG13仅具有85%的同一性。这表明如果只关注刺突RBD,穿山甲SARS样CoV SRR10168377有可能越过宿主屏障感染人类。