很明显，菲律宾是想获取南海蕴藏的油气、矿产资源。
对此，中国自然是表示强烈反对，2009年2月3日到3月12日的5个星期中，中国外交部五次就此事发表观点，其中三次声明对黄岩岛和南沙群岛拥有无可辩驳的主权，一次对菲律宾提出严正抗议，一次提出严正交涉。
也正是在中国的抗议声中，菲律宾参众两院、国会依次通过所谓的“领海基线法案”，最终由总统签署生效。
实际上，中国的地图、历史教科书，以及很多外国地图和国际公约，历来都将南沙群岛标为中国所有。而菲律宾的地图是在上世纪70年代以后，才将这些岛屿画在自己地图之上的。如果菲律宾真要提交联合国仲裁，中国也有足够充足的证据进行反驳。
正当中菲为“领海基线法案”唇枪舌剑时，美国这时候突然跑来插足，大有跟菲律宾来个遥相呼应之势。
美国海军“无瑕”号海洋侦测船
2009年3月8日，美海军第七舰队所属的监测船“无瑕”号在南海中国专属经济区从事情报收集活动，遭到中国海洋局、渔政部门和海军的五艘船只的围堵。
据当时的媒体报道说，“无瑕”号监测船上装备有特殊的声呐探测设备，其中包括一个先进的拖曳式天线阵。在与5艘中国船只对抗的过程中，拖曳式天线阵已被放进水中，中国船员曾试图用钩杆钩住拖曳式天线阵。
但是，美国方面却狡辩称那里是国际水域，执行测量任务的船上没有重型武器，船上人员都是平民身份。此外，美国甚至还反咬一口称“无瑕”号遭到了中国船只的骚扰，向中国政府提出了正式抗议。
对于这种颠倒黑白的说法，中国自然不能接受，并向美方提出了严正交涉。
而事情的根源也是《联合国海洋法公约》，中国根据《公约》围住美国海军测量船。但美国拒绝签署这项公约，并不承认“专属经济区”的存在，双方显然缺乏一定的对话前提。
而后，美国依然固执己见，不仅没有撤回“无瑕”号，还派出“钟云”号驱逐舰，为继续在南海活动的“无瑕”号护航。