1989年3月，缅甸国内最大的反政府武装“缅共人民军”瓦解，克钦独立军在武器等方面断了重要来源，其发现形势不利后同意与缅甸军政府进行停战谈判，双方于1994年2月签订了《停战协定》。缅政府承认其为“克钦邦第二特区”，下设12个县，辖区位于克钦邦东北部，与中国云南及印度的阿萨姆邦接壤。
另外，一部分不同意达成和平协议的克钦独立组织和独立军人士与旅居美、泰等国的克钦族学者、富商和基督教人士则在泰国成立了“泛克钦组织”（也称“克钦文蚌同盟”），欲在缅北建立包括克钦、阿昌、彝、拉祜、傈僳、恕、独龙等的“部落联盟的国家”。
事实上，克钦独立军内部亦纷争不断。1975年，早丹三兄弟间就发生了内讧全被打死，后布朗森被推为主席；其病故之后，主席早迈又被军中指责软弱；2001年2月，一批有欧美留学背景的少壮派军官发动兵变，从早迈手中夺过了领导权，并确定了“政治、经济和军事齐步发展，抵制缅甸政府势力进入克钦邦，武装争取民族独立”的路线，为后来的军事冲突埋下了阴影。
2011年6月战争重新开始之后，克钦独立组织已经与缅方进行过六次会谈，其中三次在靠近克钦总部拉扎附近的拉扎央进行，一次在泰国的清迈进行，另有两次在中国云南瑞丽举行。2月中旬双方约定第七次会谈，由于缅军拒绝再度到中国境内而未能举行。
另外，克钦独立军在此轮战争实践中发现缺乏中文人才有诸多制约，因此在2012年2月决定调整教育方针：继续以景颇文为主，英文为辅，着重加强中文的普及工作，从小学就开始在有条件的学校进行中文教育；中等教育以上不再设立缅语课，缅语不再作为考量学生成绩的科目；克钦独立政府工作人员的晋级考试中也将逐步增加中文成绩和汉语口语的科目。
克钦独立军军官学校也明确规定，今后将优先录取会中文的克钦族和懂克钦语的汉族，并特别欢迎懂克钦文和中文、懂英文和中文的炮兵教官到军官学校任教。
难以预料的战争趋势
2011年3月正式执政，至今接近一年时间的缅甸新政府总统吴登盛上台后推出了许多政治改革方案：释放政治犯，允许国外反对人物回国，将废除新闻审查制度……尤其是取得昂山素季所领导的全国民主联盟政治立场的转变，最终希望获得国际社会对其改革的支持及政权合法性的认可。
另外，新政府已经与多支民族武装达成了停火协议，尤其与克伦族武装能实现停战，结束了双方长达60年的争斗。
这些努力已经获得了很大成功，国际社会已经不再明确把停止武装冲突作为与缅甸关系正常化，解除贸易封锁作为前提条件，例如挪威已解除经贸制裁，欧盟也取消了对其政府高官的签证禁令，一些国际援助机构，包括官方发展援助机构（ODA）正准备重新进入缅甸。
“是否继续对克钦作战，缅甸政府内部有明显的分歧；而对于如何谈判，克钦内部也有不同看法。”JasonTower说，“比如现在已经停火的克伦族也对这场战争有意见，也希望克钦能尽快停火。克钦最高层一直只考虑谈高度自治，不考虑和谈，这个姿态已经影响到政府其他方面的努力，甚至整个国家的和解蓝图会遇到挫折。”