对于瓜达尔港，西方和南亚一些国家一直炒作所谓瓜达尔港会被中国用于军事用途，将成为进一步包围印度的“珍珠链”上的一环。对此，驻守当地的巴海军中尉沙希德对记者表示，瓜达尔港就是一个贸易港，关于军事基地的传闻只是西方和印度媒体捕风捉影的主观臆断。海军上校沙赫尔表示，瓜达尔港的建设是巴基斯坦和中国之间友谊和信任的体现，它只是为了促进贸易发展，不会对任何国家形成威胁，更不会构成对印度的珍珠链包围。
不过，瓜达尔港未来也面临挑战。阿联酋《国民报》称，安全问题可能是中巴开发瓜达尔港的最大挑战。俾路支省和中国新疆的分裂势力对瓜达尔港的建设构成了严重威胁。中巴建立贸易和能源走廊的雄心可能成为恐怖分子的人质，使数十亿美元投资处于危险之中。
巴方已经认识到开发面临的安全困境。在《环球时报》记者采访期间，受到巴海军官兵的严密保护，没有他们的许可和护送，记者无法自由前往其他地方，即使夜晚出来散步，也有警卫跟随。巴海军上校阿扎·汗对记者表示，巴十分重视瓜达尔港的安全，目前港口的运营权已经向中国移交，意义重大，已经达到了一个新的战略高度，他们加强了对当地民众和港口的保护。