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美国国土安全部也于2004年8月25日宣布选定英国航空航天公司和美国诺思罗普·格鲁曼公司研制保护美国民航飞机的导弹防御系统。两家公司提供的系统实际上是直升机或者军用运输机装备的类似系统的改进版。主要有两部分组成：一部分称作导弹逼近告警系统。通常是采用红外或者紫外告警技术，追踪导弹发动机燃烧时发出的尾焰。第二步便是干扰装置，干扰装置也有两种：红外干扰弹相对较为便宜，但是无法对付红外成像导引头等高端技术的先进便携式防空导弹；定向红外干扰系统实际上是通过发射激光，欺骗或迷惑导弹的制导系统，保护客机免受袭击，它对所有红外制导导弹几乎都有效，不过价格是红外干扰弹投放器的两倍以上。
另外，目前的便携式防空导弹最大射高在3000米左右，对于1万米以上高度巡航的客机无可奈何，因此主要用来攻击起降阶段客机，所以有些国家还研制了部署在机场地面上的飞机保护系统。
尚难对付雷达制导导弹
目前民航机自卫系统，主要是针对红外制导的便携式防空导弹。民航机即便装备了这些自卫系统，也无法对付诸如“山毛榉”这样的采用了雷达制导的中远程防空导弹。以“山毛榉”为例，它采用雷达探测、跟踪目标，并利用专门的照射雷达对目标进行照射，导弹的导引头通过接收照射雷达照射目标后的反射波来跟踪目标。对于这种系统，现有的民航自卫系统的红外诱饵弹或者红外干扰机都无法进行有效干扰。