报道称，南海问题被认为是日菲两国首脑会晤的焦点。阿基诺三世明确将得到野田佳彦在南海主权争议问题上的对己支持作为此行重点，菲方还为此提前做了大量外交努力。而这一结果，正是在对待中国的问题上，菲日两国寻求到了国家利益的某个共同点的产物。

　　“菲律宾的国家利益是多元的。阿基诺三世访华期间低调处理南海问题是为了获取更大的经济利益，而前往美国和日本高调涉及南海问题，是因为该国无法从中国那里获得军事、安全利益，但却可以从美日那边获得。”暨南大学东南亚研究所南海问题专家张明亮副教授在接受东方早报采访时说。

　　报道称，国际关系学院日本问题专家杨伯江教授对东方早报指出，相比菲律宾想拉一个域外国家支持其领土争端立场，日本的动机更具复合性，“日本为了配合美国重返亚洲战略，做出战略调整，还希望在南海问题上凸显其地区作用，日本也希望以加强东南亚国家沟通对话，进而拉近与东盟的关系，在亚太战略格局变革中，未来存在东盟与中日谁走得更近的问题。”

　　菲日联合声明要点

　　■ 两国以民主主义等共同价值观为基础加深了“战略伙伴关系”

　　■ 把副部长级双边政策磋商升级为战略对话

　　■ 日本海上保安厅支援菲律宾沿岸警备队提升能力

　　■ 促进防卫部门间的交流

　　■ 两国将作为美国的同盟国在11月的印度尼西亚东亚峰会上密切合作

　　■ 日本将继续推进对菲政府开发援助（ODA）等

　　两国希望加强全方位联系

　　昨晚公布的日菲两国联合声明涉及诸多方面，从日本关心的联合国改革问题到菲律宾国家利益的棉南老岛问题一一关照，彰显所谓“存在特殊纽带的两个邻国之间的友谊”，目的就是要提升两国全方位的、以民主主义等共同价值观为基础的战略伙伴关系。

　　日菲两国在联合声明中表示，两国要召开多层次的政策对话。“利用区域和多边会议机会，经常性举行高级别对话。将副部长级政策对话升级为副部长级战略对话，对话涉及海洋问题、打击恐怖主义和国际有组织犯罪、联合国改革、裁军和核不扩散、环境与气候变化等。

　　两国决定在2012年上半年在菲律宾举行第五次日菲政治与军事对话，以及两军对话。”声明还提出，两国将作为美国的同盟国在11月的印度尼西亚东亚峰会上密切合作。

　　野田佳彦表示，希望双方能在区域合作的框架内密切合作，对地区稳定和繁荣做出贡献。阿基诺三世则强调，双方在众多国际问题上达成共识。

　　对此刘江永分析，“日本现在不仅加强了日美同盟，还试图打造美日澳印四角关系，现在又想把菲律宾拉进来，这是中国需要注意的新动态。”

　　在海事领域合作方面，日菲在联合声明中表示要加强两个共享海上交通线的岛国在海事领域的双边合作，共同应对索马里海盗对于海上航行安全的严重威胁。

　　阿基诺三世认为日本在亚丁湾的护航行动，对菲律宾船只的航行有益。此外两国还希望加强打击亚洲海域的海盗与武装抢劫。